通过加快企业技术创新体系建设，提升两大高新产业基地发展水平，开发高新技术产品，常熟市企业自主创新能力不断提高。随着企业科技创新能力迅速增强，高新技术对常熟产业层次的提升作用日益显现。
以常熟开关制造公司、电梯曳引机厂等为代表的常熟机械行业企业，上世纪九十年代初就设立技术中心，开始引进和应用CAD技术的尝试。如今，除了产品设计外，信息化已经渗透到常熟企业发展的每一步。不断完善的技术创新体系为企业发展注入了活力，一批环保节能、新材料、现代装备、电子信息等新兴高新技术产业项目相继研发成功。常熟纺织机械厂有限公司承担的“面向纺织机械行业的设计数字化集成技术开发与应用示范”中标省制造业信息化招标项目，获得省科技厅80万元经费支持。
常熟市高分子新材料和机电一体化产业基地是国家火炬计划的两个产业基地，基地汇聚了该市60%的高新技术企业，承担了常熟70%的工业科技项目。依托产业基地，常熟市强化高新技术载体建设，引导高新技术产业集聚化发展，形成了氟化工、功能性橡塑、新型纺织材料、特种涂层材料、配电开关与控制设备、电气电力基础件及相关设备、龙芯CPU系列产品等八大产品群。高分子新材料基地形成了以中国氟化学工业园为核心的氟化工、功能性橡塑、新型化纤材料、特种涂层材料四大特色。其中常熟三爱富化工有限公司和中昊化工新材料有限公司均为我国的氟化工骨干企业，科研人员大部分来自上海有机氟材料研究所，企业每年技改投入在2亿元左右，工艺装备和技术含量国内领先。电气机械产业基地以常熟开关制造公司、江苏白雪电器公司等企业为龙头，形成了配电开关控制设备、电力电气基础件及相关设备、电子产品三个特色产品群。去年，高分子新材料、电气机械两大高新技术产业产值分别为162亿元、110亿元，同比增长30%和31%。
近年来，常熟市每年为省级星火计划、火炬计划项目提供信贷支持超亿元。同时，工业科技服务面从镇场向三大板块延伸，科技部门与三三_大板块经济发展局建立科技服务联系网络，宣传科技政策和科技服务项目。去年，常熟市省火炬计划立项数同比上一年增长100%，省高新企业数同比增长150%以上，国家高新技术企业数同比增长160%，省民营科技企业认定达到43家。
