我省科技部门围绕老工业基地的振兴，加快发展高新技术产业和用高新技术改造传统产业的步伐，大力推进实施制造业信息化工程，努力构建高新技术产业创新体系。2003年，我省高新技术产业实现总产值801.2亿元，同比增长21%。
高新区是我省高新技术产业发展的龙头。2003年，哈尔滨、大庆两个国家级高新区实现工业总产值466亿元，工业增加值112亿元。截至2003年底，哈尔滨高新区累计技工贸总收入为1316亿元，工业总产值1223亿元，实现利税182亿元，初步形成了电子信息、光机电一体化、生物工程与新医药、新材料、高效节能与环保的高新技术支柱产业群体；大庆高新区累计技工贸总收入828亿元，工业总产值575亿元，实现利税79亿元，拉动全市工业增长1.1个百分点，占全市地方工业40%。
大力实施火炬计划，促进了高新技术产业发展。我省科技部门积极申报火炬计划产业基地，促进高新技术产业群的形成。目前，已经建立了哈尔滨利民医药产业基地、牡丹江特种材料产业基地和哈尔滨抗生素产业基地三个国家火炬计划产业基地。
为扶持我省优势领域高新技术产业的发展，1998年省政府决定设立每年不低于5000万元的发展高新技术产业化专项资金，用于高新技术产业的无偿贷款和贷款贴息。2001年开始，专项资金增加到每年1.6亿元。省科技厅会同省财政厅共同制定了专项资金管理办法，与哈尔滨市商业银行合作尝试建立了发展高新技术产业投融资（基）金，支持高科技项目的实施。同时与12家银行和金融机构建立了紧密的联系。通过政府1.6亿元引导资金，吸引并形成了近9亿元规模的风险投资资金。一些地市和高新区也设立了规模不等的引导资金，拓宽了融资渠道。
我省近年来加快科技企业孵化器建设。截至2003年底，全省孵化器已发展到27家，其中包括5个国家级孵化器。2003年哈尔滨市被科技部正式批准为国家科技企业孵化器试点城市，成为全国10个国家级试点城市之一。
