(一)统筹规划我国电子商务认证机构的总体布局，规范国内电子商务认证机构的建设。
(二)组织研究和提出有关电子商务认证的法规和技术标准，为制订电子商务认证法规和技术标准提出建议。
(三)组织制订国内电子商务认证机构的有关管理、运行和安全等规章制度，管理和监督我国境内的电子商务认证机构。
(四)组织协调国内电子商务认证机构之间的交叉认证。
(五)承办信息产业部交办的其他事项。信息产业部信息化推进司负责对管理中心的业务指导和管理，中国电子商务协会具体承担管理中心的日常工作。
